沸石矿床主要是由火山玻璃质在碱性水介质的作用下，经过水化、水解和结晶等反应生成。沸石矿床的矿石主要是沸石，同时有多种类型沸石伴生，如伊利石、蒙脱石、石英等。目前被广泛应用的沸石有斜发沸石、丝光沸石、菱沸石、毛沸石、钙沸石和铁沸石等。
沸石的骨架结构是指由氧、硅和铝三种原子构成的复杂三维空间结构。结构基本单元是由一个硅或铝原子为中心、四个氧为顶点而形成的硅（铝）氧四面体。在这种四面体中，中心是硅（或铝）原子，每个硅（或铝）原子的周围有4个氧原子，各个硅氧化四面体通过处于四面体顶点的氧原子相互连接起来，各四面体连接成环状，  形成沸石的次级结构单元；沸石的结构中有时还有其他多面体，可以连接成多元环，它们是沸石结构的三级单元。作为次级和三级单元的各种环以整体形式相互连接，就形成了沸石的骨架。沸石骨架结构中存在着空洞和孔道，晶穴的体积约为总体积的40%-50%，独特的晶体结构使其具有大量均匀的微孔，孔径大多在I以下。其均匀的微孔与一般物质的分子大小相当。各种沸石都有自己特定形状和大小的空洞和孔道。一般人工合成的沸石具有形状规整、大小均匀的空洞和孔道，  能够吸附和截留特定形状和大小的分子，因此又叫分子筛；而天然沸石的孔道常有扭曲，空洞大小分布也不均匀。
在铝氧四面体中由于一个氧原子的价电子没确得到：，使得整个铝氧四面体带有一个负电荷，为保持电中性，附近必须有一个带正电荷的金属阳离子来抵消（通常是碱金属或碱土金属）。阳离子占据在骨架结构中空洞和孔道的一定位置上，与沸石骨架结构的联系较弱，具有很大的流动性，可以参加离子交换而不改变沸石的晶体结构。不同的沸石阳离子数目和种类也不问。与人上筲肌缔囱相比，天然沸石有更复杂的阳离子成分。水不参加沸石的骨架构成，仅停留在空洞和孔道的内外表面，可单独存在，也可与阳离子配位存在。