在废水处理中使用生物活性炭时，由于废水中所含的有机污染物浓度高，因此可以认为，生物活性炭主要依靠微生物的分解作用。进行净化，活性炭的作用主要为微生物的载体，吸附水中影响生物活性的金属及难降解有机物，稳定微生物的生息环境，使其可进行稳定的生物处理的作用。
好气性丝网除沫器活性炭污水处理系统的方法有颗粒活性炭及粉末活性炭，颗粒活性炭的好气1性生物处理系统如图2-18所示，颗粒活性炭I装在炭柱中，同时保持有氧的环境。粉末活性炭的好气性生物处理系统是使粉末活性炭与活性污泥同时存在，即在活性污泥的曝气槽中加入粉末活性炭，其流程如图2-19所示。这种方法可利用粉末活性炭所具有的种种特性更加稳定地进行生物处理。
在废水的兼气性生物处理方面，粉末活性炭用在兼气性接触工艺及UASB中，颗粒活性炭则以兼气性流动床或展开床的形式使用。